Surveillance des variants en France : où en sommes nous ?

Interview du Dr Bruno Coignard, Directeur maladies infectieuses, Santé Publique France

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Chapitres

•  La diffusion des variants anglais, sud africain et brésilien est-elle sous-estimée en France ? – 00:08
•  Comment s’organise la surveillance en France de ces variants ? – 00:29
•  Quelle coordination entre les laboratoires de virologie hospitaliers, les Centres nationaux de référence (CNR), l’ANRS et SP France ? – 00:51
•  Où en est-on dans la mobilisation des laboratoires privés ? – 01:40
•  Comment monter en puissance et avoir un échantillonnage régulier pour suivre les séquences et les propriétés fonctionnelles des virus ? – 02:32
•  Certains laboratoires s’équipent de plateformes capables de séquencer 200 génomes. Où en sommes-nous en matière d’équipements ? Avons-nous en France suffisamment de kits de séquençage ? – 03:36
•  Comment trouver les bonnes populations à cibler ? – 04:17
•  Le réseau Obépine surveille les variants dans les eaux usées. Avez-vous les chiffres de suivi de cette surveillance ? – 05:27
•  Aujourd’hui, quelles sont les prévisions d’évolution de ces variants dans les prochains mois ? – 06:09
•  Peut-on établir une cartographie de l’évolution de ces variants en régions ? – 07:45
•  Au delà des variants actuels, la surveillance génomique est-elle en mesure de repérer les prochaines mutations génétiques et antigéniques ? – 08:17
•  A Manaus au Brésil, alors que l’immunité collective avait été atteinte, l’apparition du variant a engendré une reprise épidémique. Quelle leçon peut-on en tirer ? – 09:56
•  Y-a-il un risque d’introduction de ce variant en Guyane ? – 10:39

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La circulation des variants d’intérêt anglais, sud africains et brésiliens est encore minoritaire sur le territoire français avec 14% des cas détectés au 27 janvier. Mais les risques de reprise épidémique, d’échappement immunitaire et vaccinal qu’ils représentent imposent à la France de renforcer rapidement leur surveillance génomique. Dans cette course contre les variants, les moyens mis en place en France sont-ils suffisants ? Le Docteur Bruno Coignard, directeur Maladies infectieuses à Santé Publique France fait un point de situation.